Le port Kilindini à Mombasa est le seul port maritime international du Kenya et le plus grand port d'Afrique de l'Est. Il dessert tout l'arrière-pays kenyan et ougandais. Il est géré par la Kenyan Ports Authority. Outre son rôle important dans le fret est-Africain, il est également fréquenté par des navires de croisière.